Het KNIR heeft een eigen publicatiereeks: Papers of the Royal Netherlands Institute in Rome.
De Papers van het KNIR beogen een forum te bieden voor een breed scala aan geesteswetenschappers gericht op Rome en/of Italië van de Oudheid tot het heden. De voertaal is Engels, maar op beperkte schaal worden ook bijdragen in het Italiaans en in andere talen opgenomen. De kernredactie bestaat uit de vier academische stafleden van het Instituut. Daarnaast is er een editorial board samengesteld met Nederlandse en buitenlandse wetenschappers. Sinds 2017 is deze reeks ondergebracht bij Edizioni Quasar.
De reeks Papers of the Royal Netherlands Institute in Rome vervolgt de eerdere publicatiereeksen van het Instituut:
Fragmenta. Journal of the Royal Netherlands Institute in Rome (2007-2013) en Mededelingen van het Nederlands Instituut te Rome (1921-2003; integraal digitaal toegankelijk in open access).